ChemOffice化学绘图软件 3D分子结构可视化高效架构工具

在化学实验室之中画结构查反应对接计算化学这样的环节, 如果只用一套工具全搞定, 那么是不是仍然需要拼凑七八个软件呢, 对于ChemOffice Suite 2020来说它把绘图检索记录以及计算这些功能捏到了一条流水线上, 但是很多人是卡在了最后一步, 也就是到底应不应该使用盗版这样的问题上。

ChemDraw出版级结构图

该软件里的ChemDraw这个模块, 是支持直接把可以拿去投稿用的那种矢量格式图片给输出出来的。在2020年发布的那个版本里, 对那个热键的体系做了一个加强。

只要你用打字儿的方式, 就能快速的去生成出相关的分子结构, 还有那些反应的式子。相比之前比较旧的那些老版本来说, 这工作效率方面的提升那叫一个明显。

通过导航热键可以实现一个按键跳转, 让你在不同分子之间进行切换, 另外, 已经绘制好的分子上随时都可以对芳香环的Kekulé表示和非Kekulé表示进行一键切换操作, 此外还有一个功能, 就是在导入CDX文件时还允许指定偏好表示。

实验记录与SignalNote

这款软件是基于PerdueElmer Signals的SignalNote个人版, 它能够记录实验数据, 还能够存储实验数据, 同时可以检索这些实验数据, 并且支持共享实验数据, 对于化学组而言, 大家最怕的情况就是数据散落在笔记本里, 或者散落在硬盘里导致找不到。

这个功能把实验记录统一到一个可以搜索的数据库里, 配合ChemACX的供应商信息, 从记录到采购一条龙完成, 省得再开Excel。

Reaxys分子与反应检索

不用把窗口切走, 在ChemDraw这个地方画完分子或者反应之后, 直接去搜索Elsevier Reaxys里面的文献数据和反应数据, 画图的操作和检索的操作, 都在同一个界面里面完成。

Reaxys的代理选项是存在的。它允许用户把搜索定向到一个特定的目标。这个目标是机构内部的特定Reaxys实例。高校和药企在用在线Reaxys的时候, 还可以做一个选择。它们选择的对象是ChemDraw JS。这个 ChemDraw JS 被用作绘图编辑器。

ChemACX供应商与价格

关于商业化的供应商以及对应的报价信息, ChemACX这个数据库里面收录了整整超过一百万种化合物的相关内容。用户只需要直接输入特定的结构信息, 然后系统就会进行反向查找操作, 最后就可以得到对应的CAS注册号以及在后面紧跟着的分子式数据。

在做采购预算的时候, 省去了去一个个网站进行翻阅的费力过程, 这项功能通过SignalNote的个人版本也能够被调用处理, 数据内容的更新基本上都是跟随供应商的变化而保持同步。

HELM生物大分子编辑

遵循Pistoia Alliance的HELM标准, 2020版内置了自定义编辑器, 蛋白质、多肽、糖类可以按HELM语法导入和编辑。

支持创建和使用自定义单体库, 在组织中管理和共享, 导出时使用HELM格式, 跨平台不丢失结构信息。

计算化学对接与正版提醒

Chem3D这个模块是和Gaussian 16, 还有GAMM 18, 另外也包括MOPAC 2016进行兼容匹配的, 同时呢, MNova ChemDraw Edition这个软件可以在桌面端上面把ID NMR数据以及LC/GC-MS数据进行直接加载处理的。

在网上流传的那些所谓破解版步骤, 其实就是把那种复制覆盖文件还有替换dll这样的做法搞一遍。这本质上属于一种盗版行为。如果机构要去面临审计或者法务风险的话, 这个代价远远省不下那几百块的软件费用。所以建议大家去走正版渠道, 或者通过学校代理渠道来购买和使用。

你目前的实验室之中, 具体是在使用什么样的化学绘图工具呢? 把ChemOffice与CDK以及Avogadro进行一番比对之后, 发现最让你感到头疼的具体是哪个环节吗? 如果你认为这些内容对你有所帮助的话, 请给予点赞的认可, 并且将其转发给那些至今还在采用手工绘制分子结构方式的同事朋友。